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高通量聲波基因組剪切儀助力基因組DNA片段化測序的實驗應用

高通量聲波基因組剪切儀通過高頻超聲波產(chǎn)生的瞬時剪切力,應用等溫、非接觸地方式對DNA樣本進行片段化;高通量超聲波基因組剪切儀對樣品的處理具有通量高、操作靈活簡便、無樣品間的交叉污染、重復性好、實驗效率高等性能特點。它被廣泛用于對細菌細胞破碎、蛋白質抽提、二代測序樣本DNA片段化、免疫共沉淀實驗等方面。

高通量聲波基因組剪切儀

在醫(yī)療應用領域,靶向治療和免疫治療的應用越來越廣泛,通過伴隨診斷試劑檢測合適的生物標志物,篩選出對藥物療效更加敏感的患者,可以使患者在臨床診療得到更加精準的治療。因此,基于高通量測序方法進行伴隨診斷試劑檢測的產(chǎn)品也日益增多。

聲波基因組剪切儀在高通量測序方法中的實驗應用方案:

1.采集樣本并對樣本進行核酸抽提

2.DNA文庫構建

①樣本準備:基因組DNA片段化

②末端修復和連接

③Pre-PCR

④雜交和雜交洗脫

⑤Post-PCR

3.測序上機

4.數(shù)據(jù)分析和藥物靶向位點篩選

DNA片段化的案例展示:

高通量聲波基因組剪切儀DNA片段化結果圖案例1

DNA片段化結果圖案例1

高通量超聲波基因組剪切儀DNA片段化結果圖案例2

DNA片段化結果圖案例2

高通量測序技術的應用具有高準確度、高通量、高自動化等應用優(yōu)勢,且隨著技術不斷改進,測序讀長和測序深度也在不斷的增加,其在醫(yī)學領域的應用也日漸廣泛。高通量聲波基因組剪切儀可以通過可調的超聲功率與工作時間去適應不同上機要求的片段長度。

聲波基因組剪切儀用于NGS測序的優(yōu)勢:

①通量高:一次可同時處理多個組織樣品,實驗效率高

②無需頻繁操作探頭:各樣品均在單獨的全封閉試管中,避免了交叉污染,不產(chǎn)生感染性飛霧,不需要額外插入超聲探頭

③可避免樣品的變性:采用4℃低溫水浴超聲波,能量分布均勻,超聲作用完全,樣品完全在低溫環(huán)境中進行,避免了樣品的變性

④樣本破碎方式:利用磁致伸縮共振超聲技術破碎樣本,多種超聲頻率同時工作,能量輸出均衡,超聲密度均一,非接觸處理,確保實驗效果一致性好

突破傳統(tǒng):全自動聲波骨骼脫鈣機帶領醫(yī)學新潮流
? 上一篇 2024年12月19日 下午2:05
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