實(shí)驗(yàn)?zāi)康模?/strong>將全基因組DNA樣品進(jìn)行100-500bp區(qū)間的片段化處理。
實(shí)驗(yàn)儀器及材料：
1.實(shí)驗(yàn)儀器：小美超聲-高通量超聲波基因組剪切儀
2.實(shí)驗(yàn)材料：核酸濃度為12ng/μL的全基因組DNA溶液
基因組樣品DNA超聲打斷的實(shí)驗(yàn)步驟：
1.提前15分鐘將三款儀器的冷水機(jī)啟動(dòng)，設(shè)置溫度為4℃。
2.將每個(gè)0.2mL EP管加入130 μL 濃度為12ng/μL的全基因組DNA溶液。
3.將2管裝好樣品的0.2mL EP 管分別放入儀器的適配器當(dāng)中，其他空余的孔位由加同樣體積水的0.2mL EP 管補(bǔ)齊。
4.程序設(shè)置：溫度4℃，超聲工作時(shí)間20s間隔時(shí)間10s，總時(shí)長分別為3分鐘和4分鐘。
5.程序結(jié)束后，取出樣品使用毛細(xì)管電泳進(jìn)行基因組片段化檢測。
基因組樣品DNA超聲打斷的實(shí)驗(yàn)結(jié)果：
1.小美超聲-高通量超聲波基因組剪切儀 程序一：
?、俪绦蛟O(shè)置：溫度4℃，超聲工作時(shí)間20s 間隔時(shí)間10s，總時(shí)長3分鐘
平均片段大小：288 bp, 101-503 bp區(qū)間占比 83.64%。
2.小美超聲-高通量聲波基因組剪切儀 程序二：
②程序設(shè)置：溫度4℃，超聲工作時(shí)間20s 間隔10s，總時(shí)長4分鐘
平均片段大?。?66 bp，99-503 bp區(qū)間占比 89.33%。
3.實(shí)驗(yàn)結(jié)果匯總：
在樣品、超聲程序設(shè)定等條件相同的情況下，使用小美超聲的高通量聲波基因組剪切儀在3分鐘和4分鐘時(shí)，100-500 bp區(qū)間占比分別為83.64%和89.33%，且二者峰圖呈平緩狀，表明基因組片段均一性良好。
